Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja5Q01231 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms