Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms