Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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