Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms