Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms