Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P58686 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P58686 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms