Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms