Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux1P53564 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux1P53564 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux1P53564 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux1P53564 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux1P53564 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux1P53564 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux1P53564 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cux1P53564 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms