Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa8P50706 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms