Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms