Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms