Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LmnaP48678 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms