Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms