Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms