Protein–RNA interactions for Protein: P23881

Tcea3, Transcription elongation factor A protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea3P23881 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea3P23881 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms