Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

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Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HdcP23738 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HdcP23738 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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HdcP23738 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HdcP23738 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms