Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms