Protein–RNA interactions for Protein: P18406

Cyr61, Protein CYR61, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyr61P18406 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyr61P18406 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms