Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gabra6P16305 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms