Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RapsnP12672 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms