Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms