Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp8O89110 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp8O89110 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms