Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms