Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb10O35955 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb10O35955 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms