Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms