Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms