Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms