Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms