Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms