Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9230113P08RikD3YWX3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9230113P08RikD3YWX3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms