Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm20547B8JJN0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20547B8JJN0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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