Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb8B1AY40 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssxb8B1AY40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb8B1AY40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssxb8B1AY40 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssxb8B1AY40 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb8B1AY40 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssxb8B1AY40 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb8B1AY40 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssxb8B1AY40 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb8B1AY40 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb8B1AY40 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb8B1AY40 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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