Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lcn6A2AJB9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lcn6A2AJB9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Lcn6A2AJB9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Lcn6A2AJB9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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