Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt27Q9Z320 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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