Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms