Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms