Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan3Q9QY33 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan3Q9QY33 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan3Q9QY33 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan3Q9QY33 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan3Q9QY33 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan3Q9QY33 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan3Q9QY33 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms