Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms