Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms