Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1Q9JIT0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms