Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms