Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Snx5Q9D8U8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx5Q9D8U8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Snx5Q9D8U8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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