Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn9Q9D805 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms