Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D7E4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms