Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms