Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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