Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms