Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DenrQ9CQJ6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DenrQ9CQJ6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms