Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa3Q9CQ71 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms