Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms